雙台子河口生態監控區  生態系統處於亞健康狀態。水體富營養化﹔溶解氧含量較低，5月份93%水域溶解氧含量超一類水質標准，8月份80%水域溶解氧含量超二類水質標准﹔石油平台附近水域存在一定程度的石油類污染﹔河口近岸海域5月份平均鹽度為33.32，接近歷史最高水平﹔其它環境指標基本保持良好。生物群落結構有所改變，浮游植物密度和浮游動物生物量增加，8月份浮游植物平均密度為9.4×105細胞/立方米，浮游動物平均生物量為985.5毫克/立方米,底棲生物種類組成以多毛類及小型貝類為主，棲息密度增加，生物量降低。河口產卵場退化，近年來魚卵仔魚種類少，密度低。蘆葦濕地生境喪失與破壞嚴重，與1987年相比，已減少60%以上。

　　監控區內油田開發、圍塘養殖、稻田開墾和過度捕撈等海洋開發活動以及陸源排污，是威脅雙台子河口生態系統健康的主要因素。

　　灤河口—北戴河生態監控區  生態系統處於亞健康狀態。海水水質和沉積物質量狀況良好。底棲動物棲息密度和生物量均呈降低趨勢，8月份平均棲息密度為212個/平方米，平均生物量為17克/平方米。海岸侵蝕嚴重，監控區內嚴重侵蝕岸段達64公裡，佔總岸段的50%。河口輸沙量減少導致底棲沉積環境改變，沉積物中沙的含量由2000年的82%降至2004年的74%。由於灤河口適於文昌魚生存的中細砂及細中砂底質環境退化，國家二級保護動物文昌魚種群數量與1999年相比，減少了63%。

　　入海淡水輸沙量減少、海水養殖密度過大、港口航運以及陸源排污是影響灤河口—北戴河生態系統健康的主要因素。

　　渤海灣生態監控區  生態系統處於亞健康狀態。海域無機氮和活性磷酸鹽污染嚴重，四類及超四類海水水質的海域面積分別為40%和20%，水體呈富營養化狀態，營養鹽比例失衡。浮游植物密度增加，6月份浮游植物平均密度為1.3×106細胞/立方米﹔浮游動物種類組成發生改變，海洋魚類的重要餌料生物哲水蚤在浮游動物中的比例下降，6月份和8月份浮游動物的優勢種類為強壯箭虫、磁蟹的蚤狀幼虫、長尾類幼虫和短尾類蚤狀幼虫等，哲水蚤已形不成優勢種類。產卵場退化，魚卵、仔魚種類少，密度低，平均每立方米有2個魚卵和仔魚。海洋漁業資源明顯衰退，如塘沽區年漁業捕撈量由80年代末的4到5萬噸，下降到近兩三年來的1.3萬噸。濱海濕地減少幅度超過50%。

　　陸源污染、過度捕撈和圍填海工程等是影響渤海灣生態系統健康的主要因素。

　　萊州灣生態監控區  生態系統處於不健康狀態。80%以上海域無機氮達到或超過四類海水水質標准，約15%的海域活性磷酸鹽超過二類海水水質標准，水體富營養化嚴重﹔營養鹽比例嚴重失衡，氮磷比8月份為485:1，范圍為21:1~2804:1﹔約30%的海域受到石油類的污染，超一類水質標准﹔8月份在50%的海域，化學耗氧量超過二類海水水質標准。浮游植物密度和浮游動物生物量增加，8月份浮游植物平均密度為1.3×107細胞/立方米，5月份浮游動物平均生物量為433毫克/立方米﹔萊州灣底部小清河口附近底棲生物多樣性差，多樣性指數小於1，耐有機污染的囊葉齒吻沙蠶在此棲息密度較高，達98個/平方米。產卵場嚴重退化，魚卵、仔魚種類少，密度低，平均每百立方米僅有數個魚卵和仔魚。近20年來的大規模圍填海使萊州灣濕地嚴重萎縮，濱海濕地一半以上已被改造為人工濕地，萊州灣南岸80%的灘涂濕地成為鹽田和養殖池﹔同時，環海公路、圍填海等工程使曲折的自然岸線，變為簡單的平直岸線，萊州灣四分之三的岸段成為平直的人工岸線。

　　陸源排污、黃河水入海量減少、不合理養殖活動及過度捕撈是導致萊州灣生態系統不健康的主要因素。

　　黃河口生態監控區  生態系統處於不健康狀態。60%以上海域無機氮達到或超過四類海水水質標准，水體富營養化嚴重，營養鹽比例嚴重失衡，8月份氮磷比平均為482:1。浮游植物密度和浮游動物生物量增加，8月份浮游植物平均密度為6.6×106細胞/立方米，5月份浮游動物平均生物量為1 298毫克/立方米﹔底棲動物生物量減少，5月份平均棲息密度為902個/平方米，平均生物量為6.3克/平方米。產卵場嚴重退化，魚卵、仔魚種類少，密度低，平均每百立方米僅有數個魚卵和仔魚。岸線存在淤積和侵蝕現象，近三年間，小沙嘴向海域方向淤進約3公裡，造陸面積約12平方公裡﹔原大沙嘴頂端繼續蝕退約1.5公裡。

　　陸源排污、黃河水入海量減少和過度捕撈等是導致黃河口生態系統不健康的主要因素。

    　　蘇北淺灘生態監控區  生態系統處於亞健康狀態。夏季全部海域無機氮超過四類海水水質標准，約40%海域的活性磷酸鹽達到或超過四類海水水質標准，水體富營養化嚴重﹔營養鹽比例失衡﹔灘涂生物受到石油烴和重金屬鎘的污染。底棲生物量明顯減少，8月份平均棲息密度為0.009個/平方米，平均生物量為0.021克/平方米，與1983年相比，分別下降了89%和78%，底棲生物資源衰退明顯。魚卵和仔魚平均密度增加，平均每立方米約有17個魚卵和11個仔魚，但重要經濟種類的比例下降，魚卵優勢種由鰳魚更替為?魚，仔魚優勢種由鯷魚更替為多鱗?。濱海濕地面積減少，2004年灘涂圍墾近萬公頃。最近兩年，文蛤連年發生大面積死亡，今年8月份以來，南通及鹽城海域貝類養殖出現了大面積死亡和紫菜的爛菜現象，受災面積佔養殖面積20%以上。

　　陸源排污、灘涂圍墾、過度捕撈和灘涂養殖等是威脅蘇北淺灘濕地生態系統健康的主要因素。

　　長江口生態監控區  生態系統處於不健康狀態。水體富營養化嚴重﹔營養鹽比例嚴重失衡，5月份和8月份表、底層海水氮磷比分別為102:1、57:1和51:1、36:1﹔在長江口東部海域底層溶解氧含量非常低，5月份為四類水質，溶解氧含量最低值為3.1毫克/升，8月份底層溶解氧含量更低，為劣四類水質，溶解氧含量的最低值僅為1.3毫克/升。長江口浮游植物和浮游動物種類組成顯著變化，長江河口區的浮游植物在20世紀90年代初期有97種，90年代末期降低至63種左右，2004年浮游植物的種類數進一步下降，5、8月份分別為21和42種，與90年代初相比減少了一倍多﹔從種類組成上看主要是硅藻種類數減少，而微型甲藻種類比例相對上升。長江河口區浮游動物在20世紀80年代初期有105種，90年代初僅有76種左右，減少28%，90年代末期進一步下降為20種左右，2004年5、8月份分別為25和31種，與90年代初相比減少60%左右。底棲動物生物量減少，海洋生物群落結構趨於簡單，生物多樣性顯著降低，2004年5月份長江河口區底棲動物種類數僅為20世紀80年代初的20%左右，密度和生物量都很低，平均棲息密度為2.5個/平方米，平均生物量為0.08克/平方米，75%的水域採不到底棲動物。產卵場退化，魚卵、仔魚種類少，密度低，平均每立方米有0.5個魚卵和1.0個仔魚。長江流域大型水利工程建設導致長江口淡水和泥沙入海量減少，其中，淡水入海量減少20%以上。海水入侵加劇，長江口北支0米以下的河槽容積減少了近60%。灘涂圍墾面積不斷增加，潮灘濕地資源損失嚴重，近3年間圍墾總面積1萬多公頃，從1989年至今，一共圍墾近4萬公頃。

　　陸源排污、河口航道整治、灘涂圍墾等開發活動是威脅長江口生態系統健康的主要因素。

　　杭州灣生態監控區  生態系統處於不健康狀態。春季全部海域無機氮超過四類海水水質標准， 50%以上的海域活性磷酸鹽達到或超過四類海水水質標准，水體嚴重富營養化，營養鹽比例失衡。浮游植物密度增加，7月份浮游植物平均密度為2.3×105細胞/立方米，海洋生物群落結構發生改變，多年調查資料表明，杭州灣底棲生物僅一個主要群落——白蝦群落，代表種為安氏白蝦和脊尾白蝦，2004年主要底棲生物演變為不倒翁、西格織紋螺和紐虫等種類。產卵場退化，魚卵、仔魚種類少，密度低，平均每立方米有0.7個魚卵和3.0個仔魚。灘涂圍墾和海岸工程導致濕地面積減少，底棲生物棲息地喪失，2004年杭州灣圍填海面積約1萬余公頃﹔近十年杭州灣南岸灘涂共圍填海約20萬公頃。

　　陸源排污、圍填海、過度捕撈以及長江水入海量減少等是導致杭州灣生態系統不健康的主要因素。

　　樂清灣生態監控區  生態系統處於亞健康狀態。春季全部海域無機氮超過四類海水水質標准，90%以上的海域活性磷酸鹽達到或超過四類海水水質標准，營養鹽比例失衡，水體嚴重富營養化。浮游植物密度增加，8月份浮游植物平均密度為3.0×106細胞/立方米，海洋生物群落結構發生改變，20世紀80年代初，樂清灣底棲生物優勢種類有雙鰓齒吻沙蠶、不倒翁虫、紅帶織紋螺、縱帶織紋螺、小莢蟶、脊尾白蝦、細螯蝦、中國管鞭蝦、三疣梭子蟹、棘頭梅童魚和龍頭魚等，2004年主要底棲生物改變為薄雲母蛤、紅帶織紋螺、西格織紋螺和不倒翁等種類。圍填海使海岸逐漸趨於平直，曲折率變小，流場改變，水動力減弱，海水交換能力下降，環境容量減少﹔水流攜沙能力降低，海灣沉積速率加劇，海灣淤積狀況嚴重，底質環境發生變化。

　　圍填海、陸源排污、海水養殖是威脅樂清灣生態系統健康的主要因素。

　　閩東沿岸生態監控區  生態系統處於亞健康狀態。春季30%以上的海域無機氮超過三類海水水質標准，50%以上的海域活性磷酸鹽超過二類海水水質標准，營養鹽比例失衡，水體富營養化。沉積物受到一定程度的有機污染。2003年3月∼2004年4月在東湖濕地及其周邊地區發現國家一級保護鳥類遺鷗、國家二級保護鳥類黃嘴白鷺、鶚、黑翅鳶、蒼鷹、紅隼、長耳鴞、短耳鴞、草鴞、褐翅鴉鵑及其它鳥類共20119隻。春季浮游植物群落結構發生改變，與1990~1991年相比，赤潮生物具齒原甲藻在浮游植物群落中上升為第二優勢種。大規模圍填海導致三都灣灘涂濕地面積不斷縮小，自建國以來已圍填海100多處，總面積1.1萬多公頃。圍填海導致生態環境退化，重要的經濟魚、蝦、蟹、貝類棲息地面積銳減，珍稀物種生存和候鳥遷徙受到威脅。監控區內因捕撈過度導致漁業資源衰退，大黃魚已經形不成漁汛，官井洋大黃魚產卵場基本消失。外來物種互花米草已侵佔1萬公頃灘涂，嚴重威脅其它海洋生物的生存。

　　圍填海、陸源排污、海水養殖、過度捕撈和外來物種入侵是威脅閩東沿岸生態系統健康的主要因素。

    

　　大亞灣生態監控區  生態系統處於亞健康狀態。大亞灣水質狀況良好，海洋生物及沉積物質量總體良好。紅樹林生境喪失嚴重，1986年至1994年紅樹林生境由84公頃降至4公頃，1999年以后才基本穩定，生境面積維持在3.6公頃左右。港口建設、海水養殖等海洋開發活動導致潮間帶生境遭受一定程度的破壞，灘涂濕地生境喪失嚴重，海岸線發生明顯變化。漁業資源量下降，產卵場功能出現衰退現象，局部海域受到熱污染影響。

　　圍填海，海水養殖，港口建設及不合理的開發活動是威脅大亞灣海洋生態健康的主要因素。隨著沿岸石油化工業的大規模快速發展，油類等化學污染對大亞灣生態系統健康將形成潛在威脅。

    

　　珠江口生態監控區  生態系統處於不健康狀態。春季95%以上的海域無機氮超過四類海水水質標准，50%以上的海域活性磷酸鹽達到或超過四類海水水質標准，營養鹽比例嚴重失衡，水體呈嚴重富營養化狀態。灘涂生物受到重金屬銅、鉛、鎘、鋅和石油烴的污染。底棲生物生物量低，7月份平均生物量為17.2克/平方米，種類組成趨於小型化。魚卵種類數量較少，7月僅有5種。整個珠江口的潮間帶生境受到毀滅性破壞，1988年以來，僅伶仃洋水域面積減少200多平方公裡，濕地功能嚴重喪失，1995年以來，深圳保安沿海海域填海面積不斷擴大，至2004年原有海岸帶地質地貌發生了顯著變化。非法採砂還導致部分海域水動力條件改變，海岸侵蝕加重。海平面上升威脅到珠江口灘涂濕地的生態健康。

　　圍填海、陸源排污、不合理的海水養殖是引起珠江口生態系統健康狀況下降的主要因素。

　　雷州半島西南沿岸生態監控區  生態系統處於健康狀態。監控區總體環境質量良好﹔餌料生物種類豐富、生物量較高﹔游泳生物資源量保持較高水平，資源量為707公斤/平方公裡，密度為104942尾/平方公裡，主要漁業資源依次為蝦類、魚類和頭足類，資源量分別為329公斤/平方公裡、308公斤/平方公裡和28公斤/平方公裡，資源結構趨於正常﹔珊瑚礁種類豐富，近年內未出現死亡現象，且監測區域內已有零星的珊瑚補充。但局部區域水體懸浮物含量高，最高達45.3 毫克/升，同時觀察到部分珊瑚礁覆蓋大量沉積物，個別珊瑚出現白化現象。

　　隨著監控區內漁業開發活動由以捕撈為主向養殖為主的轉變，雷州半島西南沿岸生態系統的健康受到潛在威脅。

　　廣西北海生態監控區  生態系統處於健康狀態。監控區總體環境質量良好，紅樹林成體植株密度為6.9棵/十平方米，平均胸徑為7.7厘米，幼苗平均密度為8.1株/十平方米，紅樹林生長與繁殖正常。林區底棲生物種類多樣性豐富﹔紅樹林生境恢復迅速，近年來有樹面積增加10％。潿洲島活珊瑚的平均蓋度為20.4%，珊瑚礁魚類蝴蝶魚、老鼠斑、石斑魚等目標觀測種類密度較高，總平均密度為34尾/百平方米，近年未出現珊瑚病害及死亡現象。目前已發現海草草場6個，總面積約400公頃，主要分布在英羅港和沙田一代﹔澱洲沙下量尾和英羅港兩個監測區域海草平均密度為25株/平方米，平均生物量為8.4克/平方米，主要分布種類為二藥藻和喜鹽草，海草床分布區域及種類組成趨於穩定，未出現嚴重退化和破壞現象。潿洲島港口建設等人為開發活動影響到周邊海域珊瑚礁生態系統﹔互花米草的大量繁殖與擴散已危及紅樹林的生長與生存﹔紅樹植物白骨壤出現了大面積的虫害。

　　陸源污染、不合理的工程開發及養殖活動以及外來物種引入威脅到廣西北海生態系統健康。

　　海南東海岸生態監控區  生態系統處於健康狀態。監控區絕大部分海域水質狀況良好。海草床生態系統相對穩定，黎安、新村港及高龍灣等水域海草蓋度及植株密度均保持較高水平，其中，黎安海域二藥藻平均蓋度達97%，新村港及高龍灣海域泰來草平均蓋度分別為73%和57%。近年來海南東海岸珊瑚礁生態系統相對穩定，珊瑚生長基本正常，未出現嚴重的病害及破壞現象。蜈支洲、榆林灣及鹿回頭海域活珊瑚的平均蓋度分別為51%、26%和20%。多數區域珊瑚恢復顯著，硬珊瑚補充量最高達1個/平方米。過度捕撈導致珊瑚礁魚類及經濟蝦、蟹、貝種群數量急劇減少。海水養殖導致長?港等局部海域水體富營養化、底棲藻類大量繁殖﹔水體懸浮物含量高、透光率下降，對珊瑚礁的正常生長與繁殖產生了嚴重威脅。河口及排污口附近污染呈加重趨勢，榆林灣、三亞河附近珊瑚礁受到一定程度損害。

　　陸源排污、過度捕撈、不合理的海水養殖活動等威脅到海南東海岸海洋生態系統健康。